Alternativas a Medifolios en Colombia 2026: 4 opciones con precio publicado, RIPS y factura electrónica

Por qué los médicos buscan una alternativa a Medifolios

Medifolios tiene trayectoria: su sitio habla de 14 años en Colombia, más de 900 IPS y más de 40 módulos. Su modelo está diseñado para crecer de consultorio a IPS sin cambiar de sistema. Pero su propia página de precios, consultada el 1-oct-2026, muestra varias cosas que pesan cuando la consulta es de uno o pocos profesionales:

• No hay un precio cerrado. El Plan Consultorio aparece "desde $100.000 COP/mes", y los planes IPS son por cotización personalizada. El sitio aclara que los precios "se ajustan según módulos, características, personalizaciones y usuarios solicitados en la cotización".
• Se paga por accesos simultáneos. Puedes crear usuarios ilimitados, pero en el Plan Consultorio solo 2 pueden ingresar al mismo tiempo (5 y 10 en los planes IPS). Más accesos simultáneos, bajo cotización.
• Planes anuales con dos tramos. Su página de licenciamiento explica que el año 1 incluye licenciamiento y configuración inicial, y que desde el año 2 se paga "menos del 40 % del valor inicial" por mantenimiento y soporte.
• Topes dentro del plan. En el Plan Consultorio, la facturación electrónica viene con 500 documentos, la historia clínica con 12 formatos y el almacenamiento se paga por GB usado.
• La norma DIAN que cita. Sus preguntas frecuentes mencionan la Resolución 042 de 2020 como norma de facturación electrónica, que la DIAN derogó con la Resolución 000165 de 2023.

Si prefieres ver la comparación uno a uno, la tenemos en Saludtools vs Medifolios: precios, RIPS y cuál elegir. Aquí ampliamos el panorama: qué otras opciones hay y cómo elegir entre ellas.

5 criterios para elegir la alternativa correcta

Antes de mirar marcas, define qué tiene que resolver el software en tu consulta. Estos cinco criterios separan un programa que funciona en Colombia de uno que solo se ve bien en la demo:

1. RIPS con la Resolución 948 de 2026 y CUV. El RIPS es el soporte de la factura electrónica en salud. El software debe generarlo con la estructura vigente, validarlo ante el Mecanismo Único de Validación y devolverte el Código Único de Validación (CUV). Sin CUV, la factura no se radica ante el pagador.
2. Precio que conozcas antes de hablar con ventas. Un valor publicado y fijo por profesional se presupuesta en un minuto. Una cotización por módulos, usuarios concurrentes o bloques de citas obliga a negociar y a recalcular cuando creces.
3. Factura electrónica dentro del plan. Pregunta si la facturación ante la DIAN está incluida, cuántos documentos trae y si hay que pagar aparte a un proveedor tecnológico.
4. Interoperabilidad y RDA. La Resolución 1888 de 2025 regula el Resumen Digital de Atención. Su implementación es progresiva y los plazos dependen del tipo de prestador, pero conviene que el software ya envíe las atenciones.
5. Sin amarres. Revisa si hay pago anual obligatorio, costo de configuración o cláusula de permanencia, y cómo te entregan tus datos si te vas.

Si quieres la lista completa de preguntas para la demo, revisa los criterios para elegir software de historia clínica en Colombia.

Las 4 alternativas a Medifolios que operan en Colombia

Todos los datos salen de la página oficial de cada proveedor, consultada el 1 de octubre de 2026. Los precios cambian: verifícalos antes de firmar.

1. Saludtools: precio fijo por profesional con la facturación incluida

Saludtools nació en Colombia y lo usan más de 7.000 médicos. Su producto gira alrededor de la norma colombiana: su página de software médico declara que genera los RIPS con la Resolución 948 de 2026, los valida antes del envío y gestiona la obtención del CUV. En la segunda quincena de agosto de 2026, 9 de cada 10 envíos hechos desde Saludtools se aceptaron en el primer intento.

• Precio publicado: según su página de precios, Estándar $89.000 COP al mes, Plus $147.000 y Premium $168.000, por médico o profesional de la salud. En pago anual: $964.000, $1.589.000 y $1.816.000. Puedes pagar mes a mes.
• RIPS y factura electrónica: incluidos en el plan Plus (hasta 100 facturas al mes) y en el Premium (ilimitadas), sin módulos ni proveedor aparte.
• Lo que viene sin costo: el usuario de la secretaria o asistente, pacientes y atenciones ilimitados, y la transferencia de información desde tu software actual.
• IA clínica (Premium): historia clínica por voz, resumen clínico, transcripción de laboratorios y triage pre consulta.
• Interoperabilidad: incluida en los planes pagos; las atenciones se envían al cerrarlas. Más en interoperabilidad de historia clínica.
• Condiciones: 15 días sin costo, sin cargos adicionales ni cláusulas de permanencia.

Es la mejor opción si eres médico o profesional independiente, o un consultorio con varios profesionales, y quieres saber hoy cuánto vas a pagar, con la facturación en salud resuelta dentro del plan y sin pagar configuración.

2. Medesk: plan gratis para empezar, módulos para facturar

Medesk es una plataforma internacional con versión para Colombia. Según su página de precios, consultada el 1-oct-2026:

• Plan Gratis: 2 usuarios, 1.000 registros de pacientes y 50 citas al mes.
• Plan Pro: se cobra por bloques de 50 citas al mes (ese día apareció en $16 por bloque; la moneda depende del país desde el que se consulte).
• RIPS y factura electrónica: son módulos adicionales, cada uno a +20 % sobre el precio base de la suscripción por citas. El de RIPS exige tener activo el de facturación, y los costos del proveedor de facturación (Facele) no están incluidos.

Puede encajar si estás empezando con pocas citas y todavía no facturas electrónicamente. La comparación detallada está en Saludtools vs Medesk.

3. MatrixMD: planes por grupo de médicos

MatrixMD es un software colombiano que cobra por paquete de usuarios, no por profesional. Según su página de precios, consultada el 1-oct-2026:

• Profesional: $180.000 COP al mes o $1.800.000 al año, para 2 usuarios médicos y 2 administrativos.
• Organización: $380.000 COP al mes o $3.800.000 al año, para 8 usuarios médicos y 8 administrativos.
• Facturación: facturación DIAN ilimitada "vía proveedor de facturación configurado o a nombre propio con su certificado digital".
• Funciones en desarrollo: el dictado de voz y el asistente de IA para la historia clínica aparecen marcados como "¡En construcción!".
• Norma citada: las preguntas frecuentes de su página de inicio explican el RIPS con la Resolución 2275 de 2023, que la 948 de 2026 derogó.

Puede encajar si son exactamente dos médicos y quieren un solo plan compartido, siempre que resuelvan aparte el proveedor de facturación.

4. HiMed Web: suscripción anual con servicios adicionales

HiMed Web es un software de historia clínica colombiano que se vende por suscripción anual. Según su página de producto, consultada el 1-oct-2026:

• Precio: $933.000 COP por la suscripción inicial anual.
• Servicios con costo adicional: la facturación electrónica, la migración de datos de historia clínica, el autoagendamiento por el portal de pacientes y las notificaciones y confirmaciones por WhatsApp.
• Interoperabilidad: incluye la de SURA; la interoperabilidad con otras entidades figura como no incluida.
• RIPS: el RIPS está entre los módulos incluidos, pero su página del módulo no menciona la Resolución 948 de 2026.

Puede encajar si buscas sobre todo historia clínica con pago anual y no necesitas facturar electrónicamente desde el mismo sistema.

Cómo comparar el costo real del primer y del segundo año

Con Medifolios el costo cambia entre el primer año y los siguientes, así que la comparación justa es a dos años. Suma lo que pagarías por un consultorio normal que factura cada mes:

• Saludtools: el mismo valor por profesional todos los años, sin configuración. Si facturas hasta 100 veces al mes, el plan Plus ($147.000 al mes o $1.589.000 al año) ya trae RIPS y factura electrónica.
• Medifolios: año 1 = licenciamiento + configuración inicial según tu cotización; año 2 en adelante, mantenimiento y soporte. Súmale lo que cotices por accesos simultáneos extra, módulos y almacenamiento por GB.
• Medesk: precio base según tus bloques de citas + 20 % por factura electrónica + 20 % por RIPS + lo que cobre el proveedor de facturación.
• MatrixMD: el plan del grupo + el proveedor de facturación que configures.
• HiMed Web: la suscripción anual + la facturación electrónica y los demás servicios adicionales que necesites.

Un detalle sobre promociones: Medifolios anuncia hoy 40 % de descuento en la licencia del primer año hasta el 31 de octubre de 2026. Un descuento sobre el año 1 no cambia el modelo de cotización ni el valor de los años siguientes, así que pide ambos números por escrito. Para ver los costos que no aparecen en ninguna página de precios (implementación, migración, soporte y topes de facturas), revisa cuánto cuesta realmente un software médico en Colombia.

Cómo pasarte de Medifolios sin perder tus historias clínicas

La historia clínica es del paciente y tú eres su custodio, no el software. Por eso, antes de firmar con cualquier proveedor, pregunta cómo te entrega los datos si decides irte. Lo explicamos en de quién es la historia clínica cuando cambias de software.

Si te pasas a Saludtools, este es el proceso real:

1. Exporta tus datos desde tu software actual: pacientes e historias clínicas en Excel, o las historias en PDF.
2. Llena las plantillas oficiales. La de pacientes pide primer nombre, primer apellido, tipo y número de documento, fecha de nacimiento y género. La de historias clínicas es flexible y solo exige el número de documento.
3. Envía la información a ayuda@saludtools.com. El equipo valida la integridad y te reporta errores o datos faltantes antes de la carga final.
4. Carga: hasta 5.000 registros, 4 días hábiles; hasta 10.000, 6 días; hasta 20.000, 8 días; hasta 50.000, 10 días, y de ahí en adelante entre 10 y 15 días hábiles. Los datos se migran sin modificar su contenido y bajo la Ley 1581 de 2012.

La transferencia está incluida desde el plan Estándar. Si quieres recorrer el producto antes, la demo online de Saludtools muestra la agenda, la historia clínica, la facturación y las funciones de IA sin agendar una llamada. Y si todavía dudas del momento, revisa las señales de que ya toca cambiar de software médico.