Saludtools vs MatrixMD 2026: precios, RIPS con la Resolución 948 y cuál elegir para tu consulta

Veredicto rápido: para quién es mejor cada uno

Cada dato de MatrixMD que citamos sale de su propio sitio (matrixmdsoftware.com), con la fecha de consulta, para que puedas comprobarlo.

• Saludtools es la mejor opción si eres médico o profesional de la salud independiente, o tienes un consultorio o centro pequeño, y quieres facturar con RIPS bajo la Resolución 948 de 2026 desde el mismo plan, con la validación y el CUV resueltos. Pagas por profesional, la secretaria va sin costo, tienes telemedicina y funciones de IA clínica disponibles hoy, lo pruebas 15 días y no hay permanencia.
• MatrixMD puede encajar si eres una clínica o grupo médico que busca, además de la historia clínica, un sistema contable con nómina, inventario multibodega y agentes de IA para ventas por WhatsApp dentro del mismo plan, y ya tienes resuelto tu proveedor de facturación electrónica o tu certificado digital.
• La pregunta que decide: ¿con qué norma salen tus RIPS? La Resolución 948 de 2026 derogó la 2275 de 2023 en mayo. Pide a cualquier proveedor que te muestre un RIPS generado con la 948, validado y con el CUV devuelto. Saludtools lo declara en su página de software médico; las preguntas frecuentes de MatrixMD, consultadas el 15-oct-2026, siguen describiendo su RIPS con la Resolución 2275 de 2023.

Las diferencias clave, punto por punto

• RIPS y norma vigente. Saludtools genera los RIPS en el formato de la Resolución 948 de 2026, los valida antes del envío y gestiona la obtención del CUV. En la sección de preguntas frecuentes de su página principal y de su página de precios, MatrixMD escribe que su generación de RIPS "cubre el artículo 1 de la Resolución 2275 de 2023". Esas dos páginas no mencionan la Resolución 948 ni el CUV.
• Cómo se cobra. Saludtools cobra por médico o profesional de la salud, y el usuario de la secretaria o asistente va sin costo. MatrixMD cobra por plan: el Profesional incluye 2 usuarios médicos y 2 administrativos, y el Organización, 8 y 8.
• Factura electrónica. En Saludtools viene dentro del plan Plus (hasta 100 facturas al mes) y del Premium (ilimitada), integrada con los RIPS. En MatrixMD la facturación DIAN es ilimitada "vía proveedor de facturación configurado o a nombre propio con su certificado digital", y su FAQ indica que para emitir necesitas un certificado de firma digital, que ofrece adquirir en un servicio de su propio ecosistema.
• Inteligencia artificial clínica. Saludtools Premium trae hoy historia clínica por voz a partir de la conversación con el paciente, resumen clínico, transcripción de resultados de laboratorio y asistente clínico por WhatsApp. En la tabla de características de MatrixMD, el "Asistente IA para obtención de datos en Historia Clínica", los "Dictados de Voz en la Historia Clínica" y la "Asistencia IA para Diagnóstico/Prescripción" aparecen marcados como "¡En construcción!".
• Telemedicina. Saludtools incluye telemedicina ilimitada desde el plan Plus. La tabla comparativa de la página de precios de MatrixMD no incluye una fila de telemedicina.
• Trayectoria. Más de 7.000 médicos usan Saludtools. MatrixMD reporta en su página principal 71 clínicas activas y 114 profesionales registrados.

Cumplimiento colombiano: RIPS, factura electrónica, CUV y RDA

Los dos son software colombianos y los dos hablan de normativa en su sitio. Lo que cambia es qué norma citan y qué tienes que resolver por tu cuenta para facturar.

RIPS con la Resolución 948 de 2026

La Resolución 948 de 2026, expedida el 14 de mayo y publicada en el Diario Oficial el 19 de mayo, derogó la Resolución 2275 de 2023 y sus modificatorias (558 y 1884 de 2024). Hoy es la norma única del RIPS como soporte de la factura electrónica de venta (FEV) en salud. Mantiene la validación previa entre el XML de la factura y el JSON del RIPS, y el CUV que resulta de esa validación es requisito para radicar la factura.

• Saludtools: su página de software médico declara que genera los RIPS en el formato de la Resolución 948 de 2026, los valida antes del envío y gestiona la obtención del CUV. En la segunda quincena de agosto de 2026, 9 de cada 10 envíos hechos desde Saludtools se aceptaron en el primer intento.
• MatrixMD: su tabla de características incluye "Funcionalidades RIPS Automatizadas", y su FAQ, consultada el 15-oct-2026, dice que genera y consolida los RIPS con usuarios, CUPS, diagnósticos, consultas y procedimientos, y que eso "cubre el artículo 1 de la Resolución 2275 de 2023". No encontramos en su página principal ni en la de precios una mención a la Resolución 948.

Que una página cite una norma derogada no prueba que el software no cumpla la nueva; puede ser texto sin actualizar. Por eso la prueba que vale es la de la demo, con un RIPS real.

Factura electrónica y validación MUV → CUV

El RIPS viaja con la factura: la FEV se valida ante la DIAN y el RIPS pasa por el Mecanismo Único de Validación (MUV) del Ministerio, que devuelve el Código Único de Validación (CUV). Por eso conviene que factura y RIPS salgan del mismo sistema y que ese sistema te muestre el estado de cada envío.

• Saludtools: factura electrónica y nuevos RIPS dentro del mismo plan, con facturación a particulares, prepagadas y EPS. El detalle está en RIPS en Saludtools.
• MatrixMD: declara facturación electrónica DIAN nativa e ilimitada, con notas crédito y documentos soporte. Para usarla configuras tu proveedor de facturación o facturas a nombre propio con tu certificado digital. Su sistema contable con nómina viene en el plan Organización, y PahFacturar se ofrece por separado.

Interoperabilidad y RDA (Resolución 1888 de 2025)

La interoperabilidad de la historia clínica y el Resumen Digital de Atención (RDA) se están implementando de forma progresiva, y los plazos dependen del tipo de prestador; la Resolución 1799 de 2026 ya modificó parte de la 1888. Para los profesionales independientes no hay todavía una fecha única.

• Saludtools: la interoperabilidad de historia clínica está en todos los planes pagos y las atenciones se envían automáticamente al cerrarlas, con el estado del envío visible en la historia. El plan Estándar incluye además interoperabilidad con SURA. Más en interoperabilidad de historia clínica.
• MatrixMD: su FAQ cita la Resolución 1888 de 2025 y dice que conserva la historia clínica con datos estructurados, controles de acceso y trazabilidad "para soportar procesos de interoperabilidad clínica". Esas páginas no detallan el envío del RDA.

Precios de Saludtools y MatrixMD en 2026 (consultados el 15 de octubre)

Saludtools

Según la página de precios de Saludtools, consultada el 15-oct-2026, los precios son por médico o profesional de la salud:

• Estándar: $964.000 COP al año ($80.333 al mes), solo en pago anual. Pacientes y atenciones ilimitados, modelos de historia clínica personalizables, usuario de la secretaria sin costo, 5 GB de almacenamiento, interoperabilidad con SURA y transferencia de información desde tu software actual.
• Plus: $1.589.000 COP al año ($132.416 al mes) o $147.000 en pago mensual. Agrega factura electrónica y nuevos RIPS (hasta 100 facturas al mes), telemedicina ilimitada, portal para pacientes, notificaciones de agenda por WhatsApp, dictado médico e integración con Siigo y Doctoralia.
• Premium: $1.816.000 COP al año ($151.333 al mes) o $168.000 en pago mensual. Facturación electrónica ilimitada, historia clínica por voz, resumen clínico, transcripción de laboratorios, asistente clínico, almacenamiento ilimitado y API de integraciones.
• Condiciones: sin cargos adicionales ni cláusulas de permanencia, y 15 días sin costo para probarlo.

MatrixMD

Según la página de precios de MatrixMD, consultada el 15-oct-2026:

• Profesional: $180.000 COP al mes o $1.800.000 al año ("2 meses gratis" en pago anual). Agenda y citas online, historia clínica, facturación DIAN vía proveedor configurado o certificado propio, 5 GB de almacenamiento y 2 usuarios médicos más 2 administrativos.
• Organización: $380.000 COP al mes o $3.800.000 al año. Agrega agentes de IA, asistente clínico, remarketing con IA, sistema contable con nómina, ventas por WhatsApp, 100 GB y 8 usuarios médicos más 8 administrativos.
• Empresarial: precio a la medida.
• Lo que corre por tu cuenta: el certificado de firma digital para facturar a nombre propio, y el costo de los mensajes de WhatsApp, que según su FAQ se factura aparte por los proveedores de la API oficial de Meta.

Si compartes consultorio con otro colega, haz la cuenta con lo que cada modelo incluye: en Saludtools cada profesional tiene su plan y la secretaria va sin costo; en MatrixMD el plan trae un cupo fijo de usuarios. Para ver los costos que no aparecen en la tabla de precios de ningún proveedor (implementación, migración, soporte, límites de facturas), revisa cuánto cuesta realmente un software médico en Colombia.

Funciones: qué trae cada uno

Lo que tienen en común

• Funcionan en la nube, desde el computador, la tablet o el celular.
• Historia clínica electrónica personalizable, consentimientos y firmas digitales.
• Agenda con citas online y confirmaciones por WhatsApp.
• Facturación electrónica, RIPS y portal de pacientes.

Donde destaca Saludtools

• RIPS 948 y factura electrónica en el mismo plan: facturas a EPS, prepagadas y particulares sin configurar un proveedor externo, con la validación y el CUV gestionados.
• IA clínica disponible hoy en Premium: historia clínica por voz, resumen clínico, transcripción de laboratorios y asistente clínico por WhatsApp. Pesa en el día a día: entre junio y agosto de 2026, el 35,7 % de las historias clínicas en Saludtools se cerró fuera del horario laboral.
• Telemedicina ilimitada desde Plus, con portal para pacientes y notificaciones de agenda por WhatsApp. El agendamiento lo puedes ver a fondo en el software de agendamiento de Saludtools.
• Secretaria sin costo en todos los planes, y migración de tu información incluida desde Estándar.
• Integraciones locales con Siigo y Doctoralia, y más de 7.000 médicos usándolo.

Lo que ofrece MatrixMD

MatrixMD, operado por MATRIXMD S.A.S., se presenta como una plataforma de operación clínica, administrativa y financiera para IPS y clínicas, con contabilidad, inventario multibodega, multisede y agentes de IA para atención y ventas por WhatsApp. Su implementación estándar, según su FAQ, toma de 1 a 3 semanas con un gerente de proyecto asignado. Para una clínica que quiere el back office contable en el mismo sistema, ese enfoque puede pesar; para un médico independiente, lo decisivo es la norma con la que salen los RIPS y lo que tienes que resolver aparte para facturar.

Si quieres ver Saludtools antes de decidir, la demo online de Saludtools recorre la agenda, la historia clínica, la facturación y las funciones de IA sin agendar una llamada. Y si estás definiendo qué necesita tu consulta según su tamaño, revisa cómo elegir software para consultorio médico en Colombia.

Cómo cambiarte de software sin perder tu historia clínica

La historia clínica es del paciente y tú eres su custodio, no el software. Antes de firmar con cualquier proveedor, pregunta en qué formato te entrega tus datos si decides irte. Lo explicamos a fondo en de quién es la historia clínica cuando cambias de software.

Si vienes de otro sistema, este es el proceso real de migración a Saludtools:

1. Exporta tus datos del sistema actual (pacientes e historias clínicas en Excel, o las historias en PDF).
2. Llena las plantillas oficiales: la de pacientes pide primer nombre, primer apellido, tipo y número de documento, fecha de nacimiento y género. La de historias clínicas es flexible y solo exige el número de documento. Los PDF se nombran con el nombre completo, el documento y la fecha de atención.
3. Envía la información a ayuda@saludtools.com. El equipo valida la integridad y te reporta errores o datos faltantes antes de la carga final.
4. Carga: hasta 5.000 registros, 4 días hábiles; entre 5.001 y 10.000, 6 días; entre 10.001 y 20.000, 8 días; entre 20.001 y 50.000, 10 días, y de ahí en adelante, entre 10 y 15 días hábiles. La información se migra sin modificar su contenido y bajo la Ley 1581 de 2012.

Si pagas tu software por año, empieza la migración unas semanas antes de la renovación para no pagar otro año mientras trasladas tu información. Si todavía no sabes si es el momento, revisa las señales de que ya toca migrar de software médico. También puedes ver cómo quedamos frente a otras plataformas en Saludtools vs HiMed Web y Saludtools vs Medifolios.